Les serpents inspirent et expirent par la bouche et la trachée. Tous serpents Sauf boas et pythons ont un poumon gauche absent ou atrophié (diminution de la taille). Le poumon droit quant à lui est hypertrophié.
D’autres espèces compensent l’absence du poumon gauche par un poumon trachéen, une extension du poumon droit qui fournit un supplément de capacité respiratoire et peut aider le serpent à respirer tout en avalant une grosse proie. Pour éviter d’étouffer, les serpents ont aussi une trachée musculeuse qu’ils peuvent amener en avant, sous la proie de façon à pouvoir continuer de respirer.
