La digestion commence dans la bouche : des glandes salivaires sécrètent des sucs digestifs pendant que le serpent mange. Chez les serpents venimeux, le venin paralyse la proie tout en contribuant à la digestion. La gorge et l’œsophage, musculeux, aident le serpent à pousser la nourriture vers son estomac (une partie plus élargie de l’intestin). Du fait de la forme étroite du serpent, l’intestin grêle et le gros intestin sont moins enroulés et donc globalement plus courts que chez les autres animaux. Les aliments non digérés sont éliminés par le rectum et le cloaque.
