Comme les mammifères et d’autres reptiles, les serpents pratiquent la fécondation interne. Les mâles ont des testicules allongés et une paire d’organes copulateurs: les hémipénis, un seul étant utilisé pendant l’accouplement. Le sperme est conduit par l’uretère des testicules jusqu’aux hémipénis. Les femelles ont en général des ovaires décalés, certaines espèces n’ayant pas d’ovaire gauche.